Adicionando arquivos fonte e .h em projeto C++ no eclipse

• Clique com o botão direito do mouse sobre a pasta src do Projeto;
• New Header File , salve com nomearquivo.h;

• Clique com o botão direito do mouse sobre a pasta src do Projeto;
• New Source File , salve com nomearquivo.cpp;

• Vá ao main.cpp
• Adicione junto às bibliotecas 
• #include "nomearquivo.h"

Pronto! É só adicionar código.